安纳托利亚牧羊犬的皮肤结构与人类的皮肤结构有很大的不同。安纳托利亚牧羊犬的皮肤比较脆弱，而且因为长了很多毛，座椅更容易引起各种细菌和真菌的附着。所以狗感染各种皮肤癣菌病的概率比人类高很多，而且治疗周期较长，往往容易复发。安纳托利亚牧羊犬一旦感染了皮肤癣菌病，通常需要主人付出更多的耐心。
通常我们说的感冒指的是安纳托利亚牧羊犬的上呼吸道感染，而不是安纳托利亚牧羊犬真正的感冒，但安纳托利亚牧羊犬的上呼吸道感染的典型症状与人类相同，包括明显的打喷嚏、流鼻涕、发烧、咳嗽等。大多数安纳托利亚牧羊犬的下颌淋巴结通常会肿大，但主人一般不会注意到。
打滚代表安纳托利亚牧羊犬的兴奋，打滚是玩耍的表现。也有可能是狗在和主人撒娇，想通过打滚来吸引他的注意力。如果安纳托利亚牧羊犬腹痛导致翻滚，建议主人及时带安纳托利亚牧羊犬到医院检查。
安纳托利亚牧羊犬洗澡水的温度可以根据季节变化进行调节:夏季最佳温度为36-38摄氏度，安纳托利亚牧羊犬体温比人体体温高1-2摄氏度。测试水温最好的方法是用手去感受。如果水温只是不冷不热，可以用手给安纳托利亚牧羊犬洗，或者用水温表测的更准。冬季洗澡水温建议在40摄氏度也比较舒服，不会觉得温度冷。
安纳托利亚牧羊犬长痘是一种常见的皮肤病，可能由真菌、螨虫、过敏性皮炎、混合性皮肤病等因素引起。最好带狗去医院检查，确诊后及时治疗。如果是皮肤病引起的痘痘，主人不仅要给狗狗吃药，还要给狗狗补充维生素，以提高免疫力，避免反复患病。
当安纳托利亚牧羊犬患耳螨时，不应用酒精或碘伏治疗。酒精虽然有杀菌消毒作用，但是太刺激了。毕竟耳螨吃耳道细胞和组织，造成伤害和感染。如果使用酒精，安纳托利亚牧羊犬可能会出现剧烈反应，疯狂甩耳朵，导致耳道严重受损。碘伏虽无刺激性，但杀灭耳螨效果甚微，不建议用于安纳托利亚牧羊犬耳道。
安纳托利亚牧羊犬是不可以吃葡萄的。安纳托利亚牧羊犬的胃肠消化功能不同于人。不是所有的水果都能吃，葡萄和葡萄干。如果吃太多葡萄或葡萄干，每公斤体重吃10-15克葡萄，安纳托利亚牧羊犬会有比较严重的中毒反应，因为安纳托利亚牧羊犬的体重不同，吃葡萄的数量也不同，还有每只安纳托利亚牧羊犬的个体差异，所以不是每只吃葡萄的安纳托利亚牧羊犬都会中毒。
细小是一种发病率非常高的传染病，传染性很强。临床上可分为肠炎和心肌炎。幼犬的一般症状是呕吐、腹泻、发烧、抑郁、食欲不振。成年犬有：食欲不振、抑郁、腹泻、严重呕吐，甚至粪便稀薄，这导致死亡率极高，但早期治疗可有效控制。
一般来说，安纳托利亚牧羊犬出生后20天左右就能走路，一个月就能走得更稳。但由于每只安纳托利亚牧羊犬的体质不同，安纳托利亚牧羊犬学习走路的具体时间会有所不同。有些体质弱的安纳托利亚牧羊犬可能要一个月才能学会走路。
如果说安纳托利亚牧羊犬拉黑便的现象一般与饮食不当有关，可能是狗粮等食物中肉类过多或脂肪含量过高，吸引力不足所致。另外，要考虑是否长期食用肝或血等食物，而安纳托利亚牧羊犬黑便则伴有呕吐、厌食和消瘦，这可能是由于长期慢性出血性胃肠炎所致。
