如果安纳托利亚牧羊犬吃太多的食物消化不了，它就会呕吐。如果安纳托利亚牧羊犬不小心吃了布料、塑料、头发等不能消化的东西，导致肠胃排异，也会导致安纳托利亚牧羊犬呕吐。也有可能因为疾病而吐槽食物，比如胰腺炎或者胃溃疡，所以主人要及时带安纳托利亚牧羊犬去医院治疗。
大多数安纳托利亚牧羊犬体内都有寄生虫，所以越早驱虫越好，但也要注意选择驱虫药物，因为不同的驱虫药物有不同的年龄限制。有的驱肠虫药可以在安纳托利亚牧羊犬一个月大的时候使用，有的需要两个月以上。使用驱虫剂时，应严格按照幼犬体重使用。剂量小的话不一定有效，剂量大的话可能会导致安纳托利亚牧羊犬中毒。
给安纳托利亚牧羊犬喂食狗粮时，最好定时、定量、定点喂食。对于3个月以下的安纳托利亚牧羊犬，由于消化系统和牙齿发育不全，需要先用温水浸泡狗粮，然后喂狗粮。它们一天可以喂3-5次。对于3个月以上的安纳托利亚牧羊犬，可以喂干狗粮，但不能直接喂干狗粮。它需要一个缓慢的过渡时间，使安纳托利亚牧羊犬的胃肠道适应缓慢，否则会导致消化不良。
对安纳托利亚牧羊犬来说，细小是一种非常高的死亡率，也是一种传染性很强的疾病。主要症状是严重的呕吐和腹泻。这个时候吃药是没有用的，因为吃药是对安纳托利亚牧羊犬胃肠道的一种刺激，刚吃完可能会呕吐，不会被身体吸收。次要治疗以抗病毒、抗炎、止血、补液、电解质调节、营养补充为主，一般采用输液、注射等治疗。
可能是因为安纳托利亚牧羊犬觉得冷，所以不停的叫。可以在猫砂上放一条电热毯，上面放一个一次性尿垫，或者把安纳托利亚牧羊犬放在母狗的肚子下面，但是要注意母狗翻身的时候会不会把安纳托利亚牧羊犬压扁。也可能是因为安纳托利亚牧羊犬想排泄，母狗会自己舔安纳托利亚牧羊犬的肛门和尿道，刺激安纳托利亚牧羊犬排泄。如果母狗没有这个操作，需要人工刺激，可以用棉签用温水浸泡。
安纳托利亚牧羊犬不能用人体沐浴露。这是因为安纳托利亚牧羊犬的皮肤pH值和人类不同。使用人体沐浴露会伤害安纳托利亚牧羊犬的皮肤，引起头皮屑增多、皮肤保护屏障受损等不良症状。日常生活中，建议主人给安纳托利亚牧羊犬洗个澡，给宠物专用沐浴露。洗澡时，主人必须清洗沐浴露，尽量不要把沐浴露留在安纳托利亚牧羊犬的体表。
安纳托利亚牧羊犬建议一天喂3餐，饲养5-6个月。因为安纳托利亚牧羊犬此时胃肠功能较弱，虽然消化系统已经发育，但还是不能消化太多食物，进食能力有限，所以要少吃多餐，有助于减轻胃肠负担。最好是逐渐将饮食从稀饭改为微水化的干粮，完成从舔到嚼的转变，减少因换食引起的消化紊乱。
一般来说，小狗的消化不良是可以自愈的。安纳托利亚牧羊犬消化不良主要是喂养管理不当造成的。所以只要改善安纳托利亚牧羊犬的喂养情况，一般都可以自愈，食物可以换成可消化的食物或者肠道处方药。如果安纳托利亚牧羊犬消化不良导致严重呕吐和腹泻，应禁食并禁止饮水，然后再送至宠物医院治疗。
安纳托利亚牧羊犬月经会有血流，如果主人介意，可以给安纳托利亚牧羊犬穿上宠物生理裤。值得注意的是，幼犬在生理期是禁止洗澡的，因为此时幼犬的子宫通道是开放的，洗澡容易使细菌滋生到幼犬体内。如果主人不打算给安纳托利亚牧羊犬配种，生理期要注意与公狗接触，穿上生理裤，过了生理期再带它去宠物医院绝育。
首先，可能是安纳托利亚牧羊犬体内有寄生虫。如果主人长时间不给安纳托利亚牧羊犬驱虫，他需要立即驱虫。其次，主人可以用安纳托利亚牧羊犬最喜欢的食物来测试狗是否挑剔。如果安纳托利亚牧羊犬愿意吃他最喜欢的食物，它是挑剔的。店主需要控制零食的数量。最后，如果安纳托利亚牧羊犬长时间抑郁，需要送到宠物医院检查治疗。
