澳大利亚牧羊犬出现腹泻和血便，说明肠上皮粘膜同时受损。如遇传染病，需及时治疗，增强抗体，修复肠上皮黏膜，防止病情进一步恶化，补充营养，选择支持疗法，恢复犬的能量供应循环，刺激澳大利亚牧羊犬自身的修复系统和免疫系统。
澳大利亚牧羊犬需要每个月驱虫一次，一次内驱和一次外驱，根据季节来选择不同的驱虫药，每种驱虫药的抗虫谱不同，侧重点也不同，需要根据当时的环境来挑选，比如夏天喜欢去草虫玩的澳大利亚牧羊犬，则需要注重蜱虫的预防，日常驱虫建议选择超可信、爱沃克、大宠爱、拜宠清、犬心保等常见驱虫药。
根据澳大利亚牧羊犬不同皮肤病的病因选择药物是必要的。如果是由寄生虫感染引起的，则需要对狗进行外部驱虫治疗。如果是过敏引起的皮肤病，要用抗过敏止痒的药物。如果皮肤湿疹是潮湿环境引起的，就要按照湿疹方案用药。
澳大利亚牧羊犬肚子上脓包的大概率可能是细菌感染引起的。感染的途径有两种，一种是有一个小伤口，由于清洗消毒不充分，造成感染和脓包，另一种是皮肤抵抗力下降导致感染。无论是什么样的感染，都需要及时处理，否则会导致传播。
澳大利亚牧羊犬不存在感冒。主人描述的感冒大多是咳嗽、打喷嚏和流鼻涕等症状。这些症状是由其他主要原因引起的。不建议主人自己用药，因为大多数主人只使用一些消炎药。在消炎药无效的情况下，会影响后续治疗。
其实，澳大利亚牧羊犬翻滚是民间关于狗胃肠道症状的另一种说法，因为在此期间，澳大利亚牧羊犬会出现呕吐和严重腹泻。当出现这种症状时，建议主人带他们去医院帮助医生判断主要原因。如果不方便带他们去医院，症状较轻，可以根据最近的精神食量做基本判断。
澳大利亚牧羊犬得了脑炎后，会有明显的脑部症状。症状较轻时，会出现一些意识障碍，如对宿主表现出陌生感或情绪不稳定。脑炎比较严重的时候会有抽搐、口吐白沫等。有的澳大利亚牧羊犬会出现耷拉脑袋、无反应、全身无力甚至倒地的情况。
正常情况下，澳大利亚牧羊犬在接种当天可使用体外驱虫药，接种后一周可服用体内驱虫药。不建议在接种当天服用体内驱虫药，因为接种传染病疫苗是利用病毒刺激机体产生抗体的过程。在这个过程中，身体各方面的免疫力都会下降。
澳大利亚牧羊犬月经结束时间一般为7～14天。大多数澳大利亚牧羊犬在8到10个月后会有第一次发情。早期的澳大利亚牧羊犬大约6个月后会有第一次发情。已故的澳大利亚牧羊犬只能在大约12个月后第一次发情。大狗可能晚一点，小狗可能早一点。性成熟正常的澳大利亚牧羊犬每年3月上旬至5月发情2次，9月下旬至11月发情1次。
不建议长期给澳大利亚牧羊犬鸡肝。一方面，鸡肝中胆固醇含量高，可能导致肝脏和胰腺问题。另一方面，如果澳大利亚牧羊犬直接吃生鸡肝，澳大利亚牧羊犬很可能感染寄生虫，对澳大利亚牧羊犬的健康构成直接威胁。在日常生活中，主人可以适当地给澳大利亚牧羊犬喂煮熟的鸡肝，但数量必须控制。鸡肝富含蛋白质、铁等微量元素，适量食用是可以的。
