日本柴犬出现腹泻和血便，说明肠上皮粘膜同时受损。如果是传染病，要及时治疗，加强其抗体，修复肠上皮粘膜，防止病情加重，补充营养，选择支持疗法，恢复犬体的供能循环，刺激日本柴犬自身的修复系统和免疫系统。
日本柴犬需要每个月驱虫一次，一次内驱和一次外驱，根据季节来选择不同的驱虫药，每种驱虫药的抗虫谱不同，侧重点也不同，需要根据当时的环境来挑选，比如夏天喜欢去草虫玩的日本柴犬，则需要注重蜱虫的预防，日常驱虫建议选择超可信、爱沃克、大宠爱、拜宠清、犬心保等常见驱虫药。
要根据日本柴犬不同皮肤病的病因来选择药物。如果是由寄生虫感染引起的，则需要对狗进行外部驱虫治疗。如果是过敏引起的皮肤病，要用抗过敏止痒的药物。如果皮肤湿疹是由潮湿的环境引起的，应按照湿疹计划服药。
有两种感染方式。一是日本柴犬本身有一个小伤口，伤口感染是由于清洗消毒不到位造成的。二是皮肤抵抗力下降引起的感染。无论何种感染，都需要及时治疗，否则会导致传播。
日本柴犬不存在感冒。主人描述的感冒大多是咳嗽、打喷嚏和流鼻涕等症状。这些症状是由其他主要原因引起的。不建议主人自己用药，因为大多数主人只使用一些消炎药。在消炎药无效的情况下，会影响后续治疗。
其实日本柴犬翻肠是另一个关于狗胃肠道症状的民间说法，因为日本柴犬在此期间会呕吐，严重腹泻。出现此类症状时，建议主人带到医院，协助医生判断主要原因。如果不方便带到医院，且症状轻微，可根据近期的精神食欲状况作出基本判断。
日本柴犬得了脑炎后，会有明显的脑部症状。当症状轻微时，会出现一些意识障碍，如对主人表现出奇怪的状态或情绪不稳定。脑炎严重时，可出现抽搐、口吐白沫。还有一些日本柴犬会出现头下垂、反应迟钝、全身无力，甚至摔倒在地。
正常情况下，日本柴犬在接种当天可使用体外驱虫药，接种后一周可服用体内驱虫药。不建议在接种当天服用体内驱虫药，因为接种传染病疫苗是利用病毒刺激机体产生抗体的过程。在这个过程中，身体各方面的免疫力都会下降。
日本柴犬通常在7到14天内结束月经期。大多数日本柴犬第一次发情是在8到10个月。早期日本柴犬第一次发情大约在6个月，晚期日本柴犬第一次发情大约在12个月。大狗可能晚，小狗可能早。性成熟正常的日本柴犬一年发情两次，大部分是上半年3-5月发情一次，下半年9-11月发情一次。
不建议长期给日本柴犬鸡肝。一方面，鸡肝中胆固醇含量高，可能导致肝脏和胰腺问题。另一方面，如果日本柴犬直接吃生鸡肝，日本柴犬很可能感染寄生虫，对日本柴犬的健康构成直接威胁。在日常生活中，主人可以适当地给日本柴犬喂煮熟的鸡肝，但数量必须控制。鸡肝富含蛋白质、铁等微量元素，适量食用是可以的。
