边境牧羊犬出现腹泻和血便，说明肠上皮粘膜同时受损。如遇传染病，需及时治疗，增强抗体，修复肠上皮黏膜，防止病情进一步恶化，补充营养，选择支持疗法，恢复犬的能量供应循环，刺激边境牧羊犬自身的修复系统和免疫系统。
边境牧羊犬需要每月驱虫一次，内驱一次，外驱一次。根据季节选择不同的驱虫剂。每种驱虫剂的抗虫谱不同，侧重点不同，需要根据当时的环境进行选择。比如夏天喜欢去草虫的边境牧羊犬，需要注意防蜱。日常驱虫药建议选择超级信任、爱行者、大宠物、白崇庆、狗心保险等常用驱虫药。
根据边境牧羊犬不同皮肤病的病因选择药物是必要的。如果是由寄生虫感染引起的，则需要对狗进行外部驱虫治疗。如果是过敏引起的皮肤病，要用抗过敏止痒的药物。如果皮肤湿疹是由潮湿的环境引起的，应按照湿疹计划服药。
边境牧羊犬肚子上脓包的大概率可能是细菌感染引起的。感染的途径有两种，一种是有一个小伤口，由于清洗消毒不充分，造成感染和脓包，另一种是皮肤抵抗力下降导致感染。无论是什么样的感染，都需要及时处理，否则会导致传播。
边境牧羊犬没有感冒这回事。主人描述的感冒大多是咳嗽、打喷嚏、流鼻涕等症状，是由其他主要原因引起的。不建议主人自行用药，因为大多数主人只使用一些消炎药，如果消炎药无效会影响后续治疗。
其实边境牧羊犬翻肠是另一个关于狗胃肠道症状的民间说法，因为边境牧羊犬在此期间会呕吐，严重腹泻。出现此类症状时，建议主人带到医院，协助医生判断主要原因。如果不方便带到医院，且症状轻微，可根据近期的精神食欲状况作出基本判断。
边境牧羊犬患脑炎后，会出现明显的脑部症状。症状较轻时，会出现一些意识障碍，如对宿主表现出陌生感或情绪不稳定。脑炎比较严重的时候会有抽搐、口吐白沫等。有的边境牧羊犬会出现耷拉脑袋、无反应、全身无力甚至倒地的情况。
正常情况下，边境牧羊犬在接种当天可使用体外驱虫药，接种后一周可服用体内驱虫药。不建议在接种当天服用体内驱虫药，因为接种传染病疫苗是利用病毒刺激机体产生抗体的过程。在这个过程中，身体各方面的免疫力都会下降。
边境牧羊犬月经结束时间一般为7～14天。大多数边境牧羊犬在8到10个月后会有第一次发情。早期的边境牧羊犬大约6个月后会有第一次发情。已故的边境牧羊犬只能在大约12个月后第一次发情。大狗可能晚一点，小狗可能早一点。性成熟正常的边境牧羊犬每年3月上旬至5月发情2次，9月下旬至11月发情1次。
不建议长期给边境牧羊犬鸡肝。一方面，鸡肝中胆固醇含量高，可能导致肝脏和胰腺问题。另一方面，如果让边境牧羊犬直接吃生鸡肝，边境牧羊犬很可能感染寄生虫，直接威胁边境牧羊犬的健康。在日常生活中，主人可以适当地给边境牧羊犬喂煮熟的鸡肝，但数量必须控制。鸡肝富含蛋白质、铁等微量元素，适量食用是可以的。
